Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PXDC1Q5TGL8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PXDC1Q5TGL8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms