Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
RSPH4AQ5TD94 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
RSPH4AQ5TD94 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RSPH4AQ5TD94 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
RSPH4AQ5TD94 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms