Protein–RNA interactions for Protein: Q5TC63

GRTP1, Growth hormone-regulated TBC protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRTP1Q5TC63 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRTP1Q5TC63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRTP1Q5TC63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms