Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LDLRAD1Q5T700 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LDLRAD1Q5T700 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LDLRAD1Q5T700 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms