Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COL5A1-AS1Q5SY13 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
COL5A1-AS1Q5SY13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms