Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV17

TMEM240, Transmembrane protein 240, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM240Q5SV17 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM240Q5SV17 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM240Q5SV17 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM240Q5SV17 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms