Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SAPCD1Q5SSQ6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SAPCD1Q5SSQ6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms