Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RTP2Q5QGT7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RTP2Q5QGT7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RTP2Q5QGT7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms