Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TCTE1Q5JU00 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCTE1Q5JU00 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms