Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBN2

TRIM61, Putative tripartite motif-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM61Q5EBN2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM61Q5EBN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM61Q5EBN2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM61Q5EBN2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms