Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TDRD12Q587J7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TDRD12Q587J7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TDRD12Q587J7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms