Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC23Q53EV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC23Q53EV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms