Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GREB1Q4ZG55 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GREB1Q4ZG55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GREB1Q4ZG55 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms