Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSR1Q2NL82 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSR1Q2NL82 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSR1Q2NL82 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms