Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERCC6LQ2NKX8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERCC6LQ2NKX8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERCC6LQ2NKX8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms