Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SPHKAPQ2M3C7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.8■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SPHKAPQ2M3C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SPHKAPQ2M3C7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms