Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC96Q2M329 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CCDC96Q2M329 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC96Q2M329 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms