Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRNQ16849 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRNQ16849 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRNQ16849 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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