Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPROQ16827 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PTPROQ16827 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTPROQ16827 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
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