Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TBR1Q16650 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TBR1Q16650 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TBR1Q16650 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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