Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTF1Q16619 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTF1Q16619 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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