Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KCNMB1Q16558 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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KCNMB1Q16558 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
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KCNMB1Q16558 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KCNMB1Q16558 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KCNMB1Q16558 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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