Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LY6EQ16553 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LY6EQ16553 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms