Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
DDB1Q16531 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
DDB1Q16531 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
DDB1Q16531 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
DDB1Q16531 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
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