Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HMGN3Q15651 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HMGN3Q15651 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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