Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RYR3Q15413 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RYR3Q15413 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RYR3Q15413 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms