Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ANKRD1Q15327 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ANKRD1Q15327 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ANKRD1Q15327 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms