Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
HERPUD1Q15011 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HERPUD1Q15011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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