Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHD4Q14839 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CHD4Q14839 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
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CHD4Q14839 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
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CHD4Q14839 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHD4Q14839 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHD4Q14839 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
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