Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPRIN1Q14444 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPRIN1Q14444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
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