Protein–RNA interactions for Protein: Q14061

COX17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX17Q14061 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX17Q14061 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX17Q14061 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX17Q14061 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX17Q14061 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COX17Q14061 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COX17Q14061 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX17Q14061 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX17Q14061 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COX17Q14061 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COX17Q14061 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COX17Q14061 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX17Q14061 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX17Q14061 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX17Q14061 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
COX17Q14061 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms