Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COL9A2Q14055 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COL9A2Q14055 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COL9A2Q14055 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms