Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CIRBPQ14011 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CIRBPQ14011 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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