Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTMR3Q13615 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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