Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IRF5Q13568 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IRF5Q13568 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IRF5Q13568 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IRF5Q13568 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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