Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KLF1Q13351 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KLF1Q13351 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
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