Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140Q13342 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140Q13342 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SP140Q13342 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SP140Q13342 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SP140Q13342 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP140Q13342 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP140Q13342 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP140Q13342 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140Q13342 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140Q13342 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140Q13342 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP140Q13342 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP140Q13342 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
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SP140Q13342 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140Q13342 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140Q13342 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP140Q13342 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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SP140Q13342 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140Q13342 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140Q13342 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140Q13342 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP140Q13342 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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SP140Q13342 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP140Q13342 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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SP140Q13342 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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SP140Q13342 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140Q13342 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140Q13342 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP140Q13342 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP140Q13342 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP140Q13342 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140Q13342 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140Q13342 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140Q13342 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP140Q13342 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140Q13342 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140Q13342 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SP140Q13342 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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