Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK5R2Q13319 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK5R2Q13319 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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