Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
PRDM2Q13029 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC40.27■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
PRDM2Q13029 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
PRDM2Q13029 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
PRDM2Q13029 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PRDM2Q13029 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms