Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SFSWAPQ12872 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFSWAPQ12872 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
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