Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN1Q12860 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTN1Q12860 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTN1Q12860 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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