Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFEMP1Q12805 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFEMP1Q12805 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFEMP1Q12805 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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