Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HOG1YLR113W 1308 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CUS1YMR240C 1311 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CMK2YOL016C 1344 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RGD2YFL047W 2145 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YER186CYER186C 921 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 OPI8YKR035C 642 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PER33YLR064W 822 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YIM2YMR151W 438 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 AIM36YMR157C 768 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 NRK1YNL129W 723 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PSH1YOL054W 1221 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SPS4YOR313C 1017 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 TOS1YBR162C 1368 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 ECM38YLR299W 1983 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CRF1YDR223W 1404 nt6.25□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 NFS1YCL017C 1494 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 ARP3YJR065C 1350 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 DOC1YGL240W 753 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 PTI1YGR156W 1278 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YRB2YIL063C 984 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HEK2YBL032W 1146 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CSI2YOL007C 1026 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YOR105WYOR105W 327 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RDL1YOR285W 420 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 UMP1YBR173C 447 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CHS5YLR330W 2016 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 BDF2YDL070W 1917 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SMC5YOL034W 3282 nt6.24□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YPL247CYPL247C 1572 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YCR108CYCR108C 192 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YPQ2YDR352W 954 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RPB7YDR404C 516 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CAB1YDR531W 1104 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YGL262WYGL262W 528 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RSR1YGR152C 819 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 AIM19YIL087C 474 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 MRT4YKL009W 711 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HOT13YKL084W 351 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 NSE1YLR007W 1011 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 DUG3YNL191W 1074 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 LTO1YNL260C 597 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 STB3YDR169C 1542 nt6.23□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SHM1YBR263W 1473 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 CRD1YDL142C 852 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 snR83snR83 306 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 DET1YDR051C 1005 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 DOG2YHR043C 741 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 DOG1YHR044C 741 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YIA6YIL006W 1122 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 BAT2YJR148W 1131 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 GET4YOR164C 939 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RPL5YPL131W 894 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 ATG14YBR128C 1035 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YCL041CYCL041C 495 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 RSP5YER125W 2430 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 HMS1YOR032C 1305 nt6.22□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 YNL247WYNL247W 2304 nt6.21□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SPS22YCL048W 1392 nt6.21□□□□□ -1.41
TY1A-NL1Q12391 SET4YJL105W 1683 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 RVS161YCR009C 798 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YDR290WYDR290W 330 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 LSM4YER112W 564 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 HSP12YFL014W 330 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 DSD1YGL196W 1287 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 CTF8YHR191C 402 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 CKA1YIL035C 1119 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 RFA3YJL173C 369 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YJR157WYJR157W 363 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 MAC1YMR021C 1254 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 MIC27YNL100W 705 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 CIN2YPL241C 807 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 MPE1YKL059C 1326 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 FKH1YIL131C 1455 nt6.21□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 PEX31YGR004W 1389 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 COQ6YGR255C 1440 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 INO2YDR123C 915 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 SPR28YDR218C 1272 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 PPX1YHR201C 1194 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YLR123CYLR123C 330 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 RPS31YLR167W 459 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YLR326WYLR326W 723 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 FUS3YBL016W 1062 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 RCL1YOL010W 1104 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 MDY2YOL111C 639 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 GAL7YBR018C 1101 nt6.2□□□□□ -1.42
TY1A-NL1Q12391 YPL261CYPL261C 309 nt6.2□□□□□ -1.42
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