Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 ACF2YLR144C 2340 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 AIM17YHL021C 1398 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 MKK2YPL140C 1521 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 SFB3YHR098C 2790 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 UTP18YJL069C 1785 nt5.7□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 FLC3YGL139W 2409 nt5.69□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 SSK22YCR073C 3996 nt5.69□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 PUS6YGR169C 1215 nt5.69□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 YOL131WYOL131W 327 nt5.69□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 TIF5YPR041W 1218 nt5.69□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 QDR3YBR043C 2070 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 HIR1YBL008W 2523 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 SCS2YER120W 735 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 GEP5YLR091W 882 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 DOM34YNL001W 1161 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 RPS19BYNL302C 435 nt5.68□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 GUA1YMR217W 1578 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 ENT2YLR206W 1842 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 CHO1YER026C 831 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 BGL2YGR282C 942 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 YLR317WYLR317W 435 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 MVD1YNR043W 1191 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 GAL10YBR019C 2100 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 PEP4YPL154C 1218 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 AVT3YKL146W 2079 nt5.67□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 YNL247WYNL247W 2304 nt5.66□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 SER33YIL074C 1410 nt5.66□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 RNR3YIL066C 2610 nt5.66□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 EPS1YIL005W 2106 nt5.66□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 ARN1YHL040C 1884 nt5.66□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 QRI1YDL103C 1434 nt5.65□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 NOT3YIL038C 2511 nt5.65□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 COG1YGL223C 1254 nt5.65□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 DCC1YCL016C 1143 nt5.65□□□□□ -1.5
TY3A-GQ12173 SCT1YBL011W 2280 nt5.65□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 PRM1YNL279W 1986 nt5.65□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 DFG5YMR238W 1377 nt5.65□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 NSI1YDR026C 1713 nt5.65□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 MSS116YDR194C 1995 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 HRP1YOL123W 1605 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YDR053WYDR053W 396 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 TAF10YDR167W 621 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YKL223WYKL223W 333 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 PEX32YBR168W 1242 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 KDX1YKL161C 1302 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 HSP104YLL026W 2727 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 SAF1YBR280C 1914 nt5.64□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.63□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 WTM1YOR230W 1314 nt5.63□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 GSY2YLR258W 2118 nt5.63□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 MCH4YOL119C 1506 nt5.63□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 HSF1YGL073W 2502 nt5.63□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 GDT1YBR187W 843 nt5.62□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 TRP3YKL211C 1455 nt5.62□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 TBF1YPL128C 1689 nt5.62□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 GYP1YOR070C 1914 nt5.62□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 ATM1YMR301C 2073 nt5.62□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 CTS2YDR371W 1536 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 LYS5YGL154C 819 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 ORM1YGR038W 669 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 RIM101YHL027W 1878 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 RHO3YIL118W 696 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 TUL1YKL034W 2277 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YML131WYML131W 1098 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 DCI1YOR180C 816 nt5.61□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 AIM10YER087W 1731 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 PAP1YKR002W 1707 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 VAN1YML115C 1608 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 DIT2YDR402C 1470 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YNG2YHR090C 849 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 MRPL39YML009C 213 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 POR1YNL055C 852 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 MAP2YBL091C 1266 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 JEM1YJL073W 1938 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 FHL1YPR104C 2811 nt5.6□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 VBA1YMR088C 1689 nt5.59□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 ECM7YLR443W 1347 nt5.59□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 ENT5YDR153C 1236 nt5.59□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 PFA3YNL326C 1011 nt5.59□□□□□ -1.51
TY3A-GQ12173 YDL027CYDL027C 1263 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YLF2YHL014C 1218 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 ABZ1YNR033W 2364 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 SRV2YNL138W 1581 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 PRP31YGR091W 1485 nt5.58□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 SPC97YHR172W 2472 nt5.57□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 RPT4YOR259C 1314 nt5.57□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 SPL2YHR136C 447 nt5.57□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YJU2YKL095W 837 nt5.56□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YNL217WYNL217W 981 nt5.56□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YIF1YNL263C 945 nt5.56□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 BPL1YDL141W 2073 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 NOP7YGR103W 1818 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 YIR007WYIR007W 2295 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 SLC1YDL052C 912 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 NSG1YHR133C 876 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 CTR2YHR175W 570 nt5.55□□□□□ -1.52
TY3A-GQ12173 RHO4YKR055W 876 nt5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14 ms