Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RIPPLY1Q0D2K3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms