Protein–RNA interactions for Protein: Q08562

ULS1, ATP-dependent helicase ULS1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ULS1Q08562 HXT16YJR158W 1704 nt7.31□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 ACP1YKL192C 378 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 YKR041WYKR041W 753 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 NMA1YLR328W 1206 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 RPA49YNL248C 1248 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 NSE5YML023C 1671 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 SIF2YBR103W 1608 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 YAR023CYAR023C 540 nt7.3□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 RPT2YDL007W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 YJL107CYJL107C 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 PCL1YNL289W 840 nt7.29□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 DCS2YOR173W 1062 nt7.29□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 MKS1YNL076W 1755 nt7.29□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 SWI1YPL016W 3945 nt7.28□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 CIN5YOR028C 888 nt7.28□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 SPN1YPR133C 1233 nt7.28□□□□□ -1.24
ULS1Q08562 SPL2YHR136C 447 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 RAT1YOR048C 3021 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 CLP1YOR250C 1338 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 TBF1YPL128C 1689 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 IDP3YNL009W 1263 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 ETT1YOR051C 1239 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YPL191CYPL191C 1083 nt7.27□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 FRE6YLL051C 2139 nt7.26□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 RAD57YDR004W 1383 nt7.25□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 SED4YCR067C 3198 nt7.25□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 POP3YNL282W 588 nt7.25□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 ELC1YPL046C 300 nt7.25□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 RET1YOR207C 3450 nt7.25□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 snR19snR19 568 nt7.24□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 STE50YCL032W 1041 nt7.24□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 SWI3YJL176C 2478 nt7.24□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 BPL1YDL141W 2073 nt7.24□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 IWR1YDL115C 1062 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 THI5YFL058W 1023 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YHR140WYHR140W 720 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 THI12YNL332W 1023 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 RFA1YAR007C 1866 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 VCX1YDL128W 1236 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 MPM1YJL066C 759 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt7.23□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 STB3YDR169C 1542 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 ACO1YLR304C 2337 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 SNU71YGR013W 1863 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 ARF2YDL137W 546 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YGL088WYGL088W 366 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 REI1YBR267W 1182 nt7.22□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 BSP1YPR171W 1731 nt7.21□□□□□ -1.25
ULS1Q08562 YLR157W-DYLR157W-D 213 nt7.21□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 HIR2YOR038C 2628 nt7.21□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 CUE2YKL090W 1332 nt7.21□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 VHS1YDR247W 1386 nt7.2□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 AZR1YGR224W 1842 nt7.2□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 YPL199CYPL199C 723 nt7.2□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 PDC1YLR044C 1692 nt7.2□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 SSZ1YHR064C 1617 nt7.2□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 RPL15BYMR121C 615 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 RGS2YOR107W 930 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 ADE3YGR204W 2841 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 GMC1YDR506C 1827 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 MAG2YLR427W 2013 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 TRS23YDR246W 660 nt7.19□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 RIM101YHL027W 1878 nt7.18□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 ZUO1YGR285C 1302 nt7.18□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 AIR2YDL175C 1035 nt7.17□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 YGR066CYGR066C 879 nt7.17□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.16□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.16□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.16□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 SUT1YGL162W 900 nt7.16□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 SLZ1YNL196C 897 nt7.16□□□□□ -1.26
ULS1Q08562 MNN4YKL201C 3537 nt7.15□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 TRP3YKL211C 1455 nt7.15□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SPR6YER115C 576 nt7.15□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 CTR2YHR175W 570 nt7.15□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 GRS1YBR121C 2004 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 NOG2YNR053C 1461 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YDR417CYDR417C 372 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 URE2YNL229C 1065 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 NPT1YOR209C 1290 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 ALD6YPL061W 1503 nt7.14□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YMR245WYMR245W 621 nt7.12□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 AIF1YNR074C 1137 nt7.12□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 ECM23YPL021W 564 nt7.12□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 CIA2YHR122W 696 nt7.12□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SAP30YMR263W 606 nt7.12□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SFB3YHR098C 2790 nt7.11□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YIL055CYIL055C 1884 nt7.11□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YOL075CYOL075C 3885 nt7.11□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 UMP1YBR173C 447 nt7.1□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 RCK1YGL158W 1539 nt7.1□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SLT2YHR030C 1455 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YBL070CYBL070C 321 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 TLG2YOL018C 1194 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SYG1YIL047C 2709 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 FOX2YKR009C 2703 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 SSH4YKL124W 1740 nt7.09□□□□□ -1.27
ULS1Q08562 YDL012CYDL012C 324 nt7.09□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms