Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LOXL1Q08397 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LOXL1Q08397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms