Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDR1Q08345 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
DDR1Q08345 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DDR1Q08345 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDR1Q08345 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms