Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PPARAQ07869 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PPARAQ07869 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPARAQ07869 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPARAQ07869 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPARAQ07869 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPARAQ07869 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PPARAQ07869 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PPARAQ07869 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPARAQ07869 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPARAQ07869 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PPARAQ07869 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPARAQ07869 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms