Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GABPAQ06546 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GABPAQ06546 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GABPAQ06546 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms